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특허법원 2021. 7. 15. 선고 2020허2253 판결

[거절결정(특)] 【전 문】【원 고】 A (소송대리인 제일특허법인(유) 담당변리사 김지선 외 2인) 【피 고】 특허청장 【변론종결】 2021. 4. 29. 【주 문】 1. 원고의 청구를 기각한다. 2. 소송비용은 원고가 부담한다. 【청구취지】 특허심판원이 2019. 12. 24. 2018원1542호 사건에 관하여 한 심결을 취소한다. 【이 유】 1. 기초 사실 가. 이 사건 출원발명 1) 발명의 명칭 : PCV2B 분지형 백신 조성물 및 사용 방법 2) 국제출원일/ 우선권주장일/ 번역문제출일/ 출원번호 : 2014. 9. 24./ 2013. 9. 25./ 2016. 3. 24./ 제10-2016-7007769호 3) 청구범위(갑 제5호증)주1) 【청구항 1】 고병독성 돼지 써코바이러스 2b형(PCV2b) 분지형 균주를 포함하는 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물로서(이하 ‘구성요소 1’이라 한다), 상기 백신 조성물이, 서열번호 66과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 PCV2b 분지형 균주에 의해 암호화되는 PCV2b 분지형 ORF2주2) 폴리펩타이드(이하 ‘구성요소 2’라 한다), 및 수중유 에멀젼 아쥬반트를 포함하고(이하 ‘구성요소 3’이라 한다), 상기 ORF2 폴리펩타이드가 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 59에 라이신(K), 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함하는(이하 ‘구성요소 4’라 한다), 백신 조성물(이하 ‘이 사건 제1항 발명’이라 부르고, 나머지 청구항들도 같은 방식으로 부른다). 4) 발명의 설명(갑 제1호증)


[가] 기술 분야
[0001] 본 발명은 돼지 써코바이러스에 관한 것이다. 더 상세하게는, 본 발명은 PCV2b 분지형 ORF2 항원을 포함하는 백신 조성물 및 고병독성 돼지 써코바이러스 2b형(PCV2b) 분지형 균주를 포함하는 PCV2 및 이유 후 전신 소모성 증후군(PMWS)에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신에서 이의 용도에 관한 것이다.
[나] 종래 기술 및 문제점
[0002] 써코비리대(circoviridae) 과, 써코바이러스(Circovirus) 속 멤버인 돼지 써코바이러스 2형(PCV2)은 1998년에 최초 발견된 작은 외피-비보유 원형 바이러스이다. PCV2는 돼지 산업에서 직면하는 가장 보편적인 두 병원체 중 하나로, 다른 하나는 마이코플라스마 하이오뉴모니애(Mycoplasma hyoneumoniae)이다. PCV2로 감염된 돼지는 통상적으로 이유 후 전신 소모성 증후군(PMWS)으로 불리는 증후군을 나타낸다. PMWS는 임상적으로 허약, 피부창백, 수척, 호흡 곤란, 설사 및 황달(icterus 및 jaundice)을 특징으로 한다.
[0003] PCV2 단리체는 현재 3가지 유전자형: PCV2a, PCV2b 및 PCV2c로 추가 세분된다.
PCV2는 복제 관련 단백질(ORF1, 945 nt), 및 바이러스 캡시드(ORF2, 702 nt)를 인코딩하는 2개의 주요한 열린 해독틀(ORF)을 함유한다. PCV2는 최근에 상당한 유전적 변화를 겪었다.
고전적 PCV2a 및 PCV2b 유전자형에 비해 ORF2-인코딩된 캡시드 단백질의 C-말단에 추가 라이신(K)을 갖는 새로 출현한 PCV2 변종이 유산된 돼지의 혈청 샘플로부터 2008년에 단리되었다(Guo 등, 2010, Virology Journal 7: 273). 상기 새로 출현한 PCV2 변종에서, 게놈 서열의 위치 1039에서 1-염기 결실이 ORF2에서 정지 코돈의 돌연변이를 일으켜(UAA부터 AAG로) 705 nt의 ORF2 유전자 및 새로운 정지 코돈을 제공한다(Guo 등, 2011, Virology Journal 8: 291). 또한, Knell 등은 이전에 한 균주의 1767 nt 게놈(유전자은행 번호 AY713470)의 위치 1042에서 결실(T)이 발견되었으므로 돌연변이가 ORF2 유전자에서 일어날 수 있고, 이것이 ORF2-인코딩된 캡시드 단백질의 C 말단에서 하나의 아미노산(라이신)으로 연장됨을 보고하였다(Knell 등, 2005, Veterinary Microbiology 109: 169-177). Olvera 등은 또한 ORF2의 정지 코돈에서의 돌연변이로 인해 캡시드 단백질의 C 말단의 하나의 라이신 잔기에 의한 연장을 보고하였다(Olvera 등, 2007, Virology 357: 175-185). 추가로, 젠뱅크(GenBank) 수탁번호 JQ413808을 갖는 JSTZ로 명명된 PCV2 균주가 중국에서 중증설사를 하는 새끼돼지의 대변 샘플에서 검출 및 확인되었고, 그것의 전체 1767 nt 게놈이 서열분석 되었다(Li 등, 2012, Journal of Virology(jvi.asm.org), p. 4716). PCV2 균주 JSTZ의 게놈 및 다른 중국 PCV2 균주의 ORF에 기반한 계통발생적 분석은 PCV2 균주 JSTZ가 중국의 신규 유전자형에 속함을 시사하였다(Li 등, 2012, 상기와 동일).
[0004] Guo 등은 PMWS로 유산된 돼지 샘플에서 2008년에 회수된 PCV2b/rBDH 또는 BDH로 명명된 PCV2 변종 균주(젠뱅크 수탁번호 HM038017)의 상대 병독성을 평가하였고, 새끼돼지에서 고전적 PCV2a 및 PCV2b 유전자형과 관련된 것보다 PCV2 변종 균주의 더 큰 병독성을 확인하였다(Guo 등, 2012, PLoS ONE(plosone.org), Vol. 7, Issue 7, e41463, 1-10). 상기 PCV2 변종 균주는 허약, 기침, 호흡곤란, 설사, 거친 모발-코팅 및 우울증을 특징으로 하는, PMWS와 양립 가능한 더 중증 징후를 나타내었다. 게다가, 병리적 병변 및 바이러스혈증 뿐만 아니라 림프절, 편도, 및 비장에서의 바이러스 부하는 고전적 PCV2a 및 PCV2b로 유발접종된 군에 비해 PCV2 변종 균주로 유발 접종된 새끼돼지에 있어서 유의미하게 더 중증이었다. 또한, 유행하는 PCV2a 및 PCV2b 유전자형로 유발접종된 군에 비해 PCV2 변종 균주로 유발접종된 군에서 유의미하게 더 낮은 평균 1 일 체중 증가가 기록되었다(Guo 등, 2012, 상기와 동일).
[0005] 2개의 PCV2 균주, US22625-33 및 US22664-35는 미국에 위치한 생산 시스템에서 PMWS-이환 돼지의 의심되는 백신 실패 사례에서 최근에 확인되었다(Xiao 등, 2012, Journal of Virology(jvi.asm.org), Vol. 86, No. 22, p. 12469). 이들 두 미국 균주의 전체 게놈은 1767 nt로 이루어지고, 그 ORF2 유전자 크기는 일반적인 PCV2보다 1개 아미노산이 더 긴 234 aa의 ORF2 단백질을 인코딩하는 705 nt인 것으로 나타났다. 고전적 PCV2a 및 PCV2b 균주의 ORF2의 뉴클레오타이드 서열을 이용한 계통발생적 분석은 두 미국 PCV2 균주 US22625-33 및 US22664-35가 PCV2b에 밀접하게 관련됨을 제시하였다. 고전적 PCV2b에 비해, ORF2 유전자 내의 단일 염기 결실은 ORF2 단백질의 C-말단에 단일 아미노산(라이신) 부가를 일으켰다. 추가 서열 BLAST 및 비교는 두 미국 PCV2 균주가 중국에서 확인된 PCV2 균주, BDH와 고수준의 동일성(99.9%)을 가짐을 나타내었고, 병독성이 증가된 것으로 보고되었다. ORF1에서 하나의 침묵 돌연변이(1677A→1677T)가 BDH 및 2개의 미국 변종 PCV2 간에 발견되었다. 새로운 PCV2 유전자형 정의 및 명명법 기준(Cortey, 등, 2011, Vet. Microbiol. 149:522-523; Segales, 등, 2008, Vet. Rec. 162:867-868)에 따르면, 이들 모든 신규 변종 PCV2 균주는 ORF2 유전자 뉴클레오타이드 서열의 계통발생적 분석에 기반하여 유전자형 PCV2b로 분류될 수 있었다(Xiao 등, 2012, 상기와 동일).
[다] 기술적 과제
[0006] 새로운 PCV2b 분지형의 증가된 병독성 보고와, 미국에서 의심되는 백신 실패 사례에서의 그 존재의 측면에서, 상기 새로운 PCV2b 분지형에 대해 유효한 백신이 필요하다. 바람직하게는, 상기 백신은 다른 돼지 항원, 예컨대 마이코플라스마 하이오뉴모니애 및 PRRS 바이러스와 상용성일 것이다.
[라] 발명의 설명
[0007] 본 발명은 고병독성 돼지 써코바이러스 2b형(PCV2b) 분지형 균주를 포함하는 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물을 제공하고, 상기 조성물은 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드를 포함하고, 상기 ORF2 폴리펩타이드는 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함한다.
일 구현예에서, 상기 조성물은 또한 고전적 PCV2a 및 PCV2b 균주에 대한 이종성 보호를 제공한다.
[0008] 일 구현예에서, 상기 조성물은 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드를 포함하고/하거나 발현하는 불활성화된, PCV2b 분지형 전체 바이러스 형태이다.
[0009] 또 하나의 구현예에서, 상기 조성물은 불활성화된 키메라성 바이러스 형태이고, 상기 키메라성 바이러스는 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드를 포함하고/하거나 발현하는 불활성화된 재조합 돼지 써코바이러스 1형을 포함한다.
[0012] 또 하나의 구현예에서, 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함하는 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드에는 서열번호 1의 넘버링에 따라 잔기 59에 라이신(K) 및 잔기 234에 라이신(K)이 추가로 포함된다.
[0014] 일 구현예에서, PCV2 분지형 ORF2 폴리펩타이드는 서열번호 1의 아미노산 서열 또는 이의 단편으로 나타난다.
[0017] 일부 구현예에서, 본 발명의 조성물에는 아쥬반트가 추가로 포함된다. 일 구현예에서, 아쥬반트는 비제한적으로 수중유 아쥬반트, 폴리머 및 물 아쥬반트, 유중수 아쥬반트, 알루미늄 하이드록사이드 아쥬반트, 비타민 E 아쥬반트 및 이들의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 또 하나의 구현예에서, 본 발명의 조성물에는 약학적으로 허용가능한 담체가 추가로 포함된다.
[0094] 서열번호 66은 PCV2b-DIV-MUT로 명명된 PCV2 분지형의 전체 게놈 서열이다.
[0098] 본원에서 사용된 바와 같이, 용어들 PCV2b 분지형 균주, PCV2b 분지형, PCV2 변종, 신규한 변종 PCV2, 변종 PCV2 등은 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함하는 ORF2 캡시드 폴리펩타이드를 인코딩하는 고병독성 PCV2b 균주를 나타낸다. 인코딩된 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드에는 하기로부터 선택되는 하나 이상의 잔기가 추가로 포함될 수 있다: 서열번호 1의 넘버링에 따라 잔기 59에 라이신(K), 잔기 234에 라이신(K), 잔기 190에 트레오닌(T), 잔기 53에 이소류신(I), 잔기 68에 아스파라긴(N), 잔기 169에 아르기닌(R) 또는 글리신(G) 및 잔기 215에 이소류신(I).
[0132] PCV2b 분지형 ORF2 항원 성분은 원하는 면역 반응, 즉 그 예가 본원에서 PCV2B-DIV-MUT로 명명된 바이러스인 고병독성 PCV2b 균주의 감염으로 생성된 임상 징후의 발생률 감소 또는 중증도 경감을 유도하기 효과적인 항원 편입 수준으로 면역원성/백신 조성물 중에 제공된다. 일부 구현예에서, 조성물은 또한 고전적 PCV2a 및 PCV2b 균주에 대해 이종성 보호를 제공한다.
[0144] 본 발명의 백신에서 유용한 수중유 에멀젼의 비-제한적인 예에는 변형된 SEAM62 및 SEAM 1/2 제형이 포함된다. 변형된 SEAM62는 5%(v/v) 스쿠알렌(Sigma), 1%(v/v) SPAN� 85 세제(ICI Surfactants), 0.7%(v/v) TWEEN� 80 세제(ICI Surfactants), 2.5%(v/v) 에탄올, 200 ㎍/mL Quil A, 100 ㎍/mL 콜레스테롤 및 0.5%(v/v) 레시틴을 함유하는 수중유 에멀젼이다. 변형된 SEAM 1/2은 5%(v/v) 스쿠알렌, 1%(v/v) SPAN� 85 세제, 0.7%(v/v) Tween 80 세제, 2.5%(v/v) 에탄올, 100 ㎍/mL Quil A 및 50 ㎍/mL 콜레스테롤을 포함하는 수중유 에멀젼이다.
[마] 실시예
[0172] 실시예 1: 키메라성 돼지 써코바이러스(cPCV)1-2 생산 방법
[0173] 비병원성 돼지 써코바이러스 1형(PCV1)의 게놈 골격 내로 병원성 돼지 써코바이러스 2b형 분지형 균주(PCV2B-DIV-MUT로 명명됨)의 면역원성 캡시드 유전자의 클로닝에 의해 cPCV1-2를 구축한다.
[0187] 실시예 2: 재조합 PCV2b 분지형 캡시드 단백질의 제조 방법
[0188] 서브유닛 백신의 생산은 2상 방법: 첫 번째로, 배큘로바이러스 발현 시스템에서 ORF2 서브유닛 항원 생산 및 두 번째로, 최종 생성물의 제형화/제조의 결과이다. 초기 단계(재조합 배큘로바이러스 구축 및 ORF2 항원의 생산)를 위해, 사용된 기본 기술 방법이 이제 기재될 것이다. 배큘로바이러스 발현 시스템이 PCV2b 분지형 균주로부터 ORF2 유전자의 발현을 위해 사용된다.
[0195] 실시예 3: 불활성화된 PCV2b 분지형 전체 바이러스의 제조 방법
[0196] PCV2b 분지형 바이러스: PCV2B-DIV-MUT의 감염성 스톡을 사용하여 0.05% 락트알부민 가수분해물(LAH), 30 ㎍/mL 겐타마이신 설페이트 및 5% 우태 혈청으로 보강된 최소 필수 배지(MEM) 중에 성장시킨 돼지 신장(PK)-15 세포를 감염시킨다.
[0203] 실시예 4: 원리 연구의 PCV2b 증명
[0204] 본 연구의 목표는 동종성 및 이종성 보호에 대해 PCV2b 분지형 후보 백신을 평가하는 것이었다. 연구 설계는 표 3에 개괄된다.
[0214] 표 4 및 5에 명시된 바와 같이, 결과는 돼지가 유발접종 전에 PCV2 바이러스혈증 및 대변 박리에 대해 음성으로 유지되었음을 시사하였다. 그러나 연구에 걸쳐, PCV2 바이러스혈증(표 4) 및 PCV2 대변 박리(표 5)에 대한 정량적 PCR에 의해 평가된 바와 같이, 모든 치료군의 모든 돼지는 일부 시점에서 PCV2에 대해 양성이 되었다.
[0225] 실험적인 PCV2b 분지형 백신 치료(T04, T08, 및 T12)는 수치적으로 PCV2 바이러스혈증(표 4) 및 대변 박리(표 5)를 감소시켰다. 이는 또한 면역조직화학(IHC) 스코어(표 7), 및 림프모양 고갈 스코어(표 8)에 의해 실증된 바와 같이, 위약과 비교된 경우 대부분의 시점에서 조직병리적 병변의 감소로 이어졌다...(중략)...본 연구에서는 통계적 비교를 수행하지 않았으나, PCV2b 분지형 백신 치료가 PCV2a, PCV2b 및 PCV2b-분지형 유발접종 균주에 대해 보호를 제공하였음은 분명하다.
[0226] 본 연구에서는, PCV2b 분지형 백신이 PCV2a 또는 PCV2b 백신보다 PCV2b 분지형 유발접종에 대해 수치적으로 더 우수하게 작용했음을 주지하는 것이 중요하다.
[0248] 실시예 6: PCV2b 유발접종에 대한 2개 백신 후보의 평가
[0249] 본 연구의 목표는 각각 PCV2b 유발접종에 대해 저 및 고 항원 용량으로 제시되는 키메라성 PCV2b 백신 및 PCV2b 분지형 백신의 보호를 평가하기 위한 것이었다. 연구 설계는 표 10에서 개괄된다.
[0287] 상기 연구로부터의 데이터는 연구 상의 모든 돼지가 하기에 의해 입증된 바와 같이 21 일째의 유발접종까지 PCV2 감염이 없는 채 유지되었음을 명시하였다: 1) 예방접종시부터 유발접종 시까지 매주 간격으로 수집된 혈청 중 검출가능한 PCV2 DNA의 부재, 및 2) 유발접종 전 PCV2에 대한 임의의 의도되지 않은 노출이 없는 T01 군 사이에서 혈청학적 증거의 부재. 모든 백신은 예방접종된 동물이 유발접종 후 바이러스혈증이 되는 것을 유의미하게 보호하였다. 또한, 모든 백신은 예방접종된 동물에서 유발접종 후 PCV2의 대변박리를 유의미하게 감소시켰다. 모든 백신군에서의 돼지는 위약과 비교된 경우, 예방접종 후 28 내지 44 일에 PCV2 항체 역가의 유의미한 증가(P ≤ 0.0895)를 나타내어, 예방접종 후 PCV2에 대한 활성 면역 반응을 시사하였다. 모든 예방접종군 대 대조군에서 군집화의 수치적 감소(IHC)가 있었으나, 통계적으로 유의미하지는 않았다. 군 간 유의차의 부재는 대조군에서 나타난 약한 유발접종 섭취에 기인할 수 있었다.
[0288] 실시예 7: PCV2b-분지형 유발접종에 대한 2개 백신 후보의 평가
[0289] 본 연구의 목표는 각각 PCV2b 분지형 유발접종에 대해 저 및 고 항원 용량으로 제시되는 키메라성 PCV2b 백신 및 PCV2b 분지형 백신뿐만 아니라 배큘로바이러스에서 발현된 PCV2a 캡시드의 보호를 평가하기 위한 것이었다. 연구 설계는 표 16에서 개괄된다.
[0332] 본 연구는 cPCV1-2b, PCV2b 분지형 및 PCV2a 캡시드 백신을 발현하는 배큘로바이러스가 PCV2b 분지형 균주 유발접종에 대해 교차 보호함을 나타내었다.

나. 선행발명들주3) 1) 선행발명 1(갑 제9호증, 을 제1호증) 선행발명 1은 2011. 9. 22. 공개된 국제특허공개공보 WO 2011-116094호에 게재된 ‘생약독화 키메라 돼지 써코바이러스 백신(LIVE ATTENUATED CHIMERIC PORCINE CIRCOVIRUS VACCINE)’에 관한 것으로, 그 주요 내용주4) 및 도면은 다음과 같다.


[가] 기술 분야
[0002] 본 발명은 돼지 써코바이러스(PCV)의 감염성 DNA 클론, 생약독화 및 불활성화 백신, 특히 PCV1 및 PCV2의 키메라 바이러스, 특히 아형 PCV2b, 및 PCV 감염 및 돼지 써코바이러스 관련 질병(PCVAD)으로부터 보호하는 방법에 관한 것이다.
[나] 배경기술
[0004] PK-15 세포주 유래 PCV1 바이러스를 사용한 돼지의 접종은 돼지에서 질병을 유발하지 않았기 때문에 PCV1은 비병원성 바이러스인 것으로 간주되었다. 1997년에, PCV 2형(PCV2)으로 지정된 PCV의 변형 균주가 캐나다에서 소모성 질병을 갖는 새끼 돼지에서 발견되었다(...중략...) PCV2는 현재 전 세계 돼지 개체군에서 가장 경제적으로 중요한 바이러스성 병원체 중 하나로 간주되며, 세계의 모든 주요 돼지 생산 국가에서 발견된다.
[0005] 병원성 PCV2 및 비병원성 PCV1의 게놈 조직은 유사하지만, PCV1 및 PCV2의 게놈은 단지 대략 68 내지 76% 뉴클레오티드 서열 동일성을 공유하고, 그리고 전사 패턴 및 캡시드 단백질의 항원 프로필에 차이가 있음이 보고되었다...(중략)...rep 유전자는 약 83% 뉴클레오티드 서열 동일성과 함께 PCV1과 PCV2 사이에서 고도로 보존되는 반면, cap 유전자는 약 67 내지 70% 동일성을 공유한다.
[0006] 현재 이용 가능한 상용 백신은 PCV2a 아형에 기초한 모든 사멸 또는 재조합 백신이다. 본 발명자들은 이전에 (PCV1의 백본에서 PCV2a의 캡시드 유전자를 사용하여) PCV1-2a 키메라 바이러스에 기초한 불활성화 백신인 Suvaxyn PCV2� One dose™를 성공적으로 개발하였다...(중략)... 그러나 PCV2b 아형은 현재 상용 돼지에서 심각한 임상 PCVAD와 관련된 세계적으로 지배적인 유전자형이 되었고, PCV2a 및 PCV2b는 10% 뉴클레오티드 서열 동일성만큼 상이하기 때문에, 현재 PCV2a 아형계 사멸 또는 재조합 백신이 새롭게 인식된 PCV2b 아형에 대해 완전한 보호를 제공하는지 여부는 알려져 있지 않다.
여러 연구에서 PCV2b 과제에 대한 현재 상용 백신의 유효성을 입증하였으나, PCVAD에 대해 PCV2b 아형계 백신, 바람직하게는 생약독화 백신을 개발하는 것이 필수적이다. 새로운 PCV2b 아형에 기초한 생약독화 백신은 PCV2a 아형에 기초한 현재 이용 가능한 사멸 및 서브유닛 백신보다 업계에서 훨씬 더 큰 보호를 제공할 것이다.
[다] 발명의 구성
[0007] 본 발명은 1형 PCV(PCV1)의 게놈 서열로부터 유래된 비병원성 키메라 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 2형 PCV(PCV2), 바람직하게는 아형 PCV2b의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 돼지 써코바이러스(PCV)의 핵산 분자를 제공한다.
[0008] 본 발명의 일 실시형태에서, PCV2의 캡시드 단백질의 인코딩 서열은 아형 PCV2a, PCV2b 및 PCV2c로 이루어진 군으로부터 선택된다.
[0009] 본 발명의 일 실시형태에서, PCV2의 캡시드 단백질의 인코딩 서열은 아형 PCV2b의 인코딩 서열이다.
[0010] 본 발명의 다른 실시형태에서, PCV2의 캡시드 단백질의 인코딩 서열은 PCV2, 바람직하게는 아형 PCV2b의 오픈 리딩 프레임 2(ORF2)의 적어도 일부이다.
[0012] 본 발명은 1형 PCV(PCV1)의 게놈 서열로부터 유래된 비병원성 키메라 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 2형 PCV(PCV2), 바람직하게는 아형 PCV2b의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 함유하는 생물학적 기능성 플라스미드 또는 바이러스 벡터를 제공한다.
[0013] 본 발명은 1형 PCV(PCV1)의 게놈 서열로부터 유래된 비병원성 키메라 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 2형 PCV(PCV2), 바람직하게는 아형 PCV2b의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 벡터에 의해 형질감염된 적합한 숙주 세포를 더 제공한다.
[0014] 본 발명은 1형 PCV(PCV1)의 게놈 서열로부터 유래된 비병원성 키메라 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 2형 PCV(PCV2), 바람직하게는 아형 PCV2b의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 벡터에 의해 형질감염된 적합한 숙주 세포에 의해 생성된 무독성, 감염성 키메라 PCV를 더 제공한다.
[0015] 본 발명은 2형 PCV(PCV2), 바람직하게는 아형 PCV2b의 캡시드 단백질의 적어도 일부를 포함하는 불활성화 키메라 PCV를 더 제공한다.
[0023] 본 발명의 또 다른 실시형태에서, 상기 백신은 PCV2a 및 PCV2b 감염에 대하여 보호한다.
[라] 실시예
[0042] 실시예 1
[0043] PCV1 및 PCV2 바이러스 분리주:
[0044] PCV2a 분리주 ISU-40895(서열 ID 번호: 1, Genbank 수탁 번호 AF264042)는 1998년 아이오와 농장에서 PCVAD를 가진 돼지로부터 회수되었고 PCV2 병원성 연구에서 광범위하게 사용되었다. PCV2a-40895는 실험 조건에서 PCVAD 미세 병변 및 임상 질환을 유발할 수 있다. 연구에 사용된 PCV2b 균주는 전체 바이러스 게놈(서열 ID 번호: 2, Genbank 수탁 번호 GU799576)의 서열분석에 의해 진정한 PCV2b 아형인 것으로 확인되었다. PCV2b의 게놈 DNA를 키메라 PCV1-2b 감염성 DNA 클론뿐만 아니라 PCV2b의 감염성 DNA 클론의 구축을 위한 공급원으로 사용하였다. PCV2b 바이러스의 병원성은 본 발명 이전에 실험 감염에서 결정되지 않았다.
[0045] 실시예 2
[0046] PCV2b 및 키메라 PCV1-2b의 감염성 DNA 클론의 생성:
[0047] PCV2a-40895의 감염성 DNA 클론의 구축 방법은 이전에 보고된 바 있으며, 본 발명에서는 PCV2b의 감염성 DNA 클론을 생성하기 위해 유사한 접근법이 사용되었다(도 1a).
[0048] 키메라 PCV1-2b 감염성 DNA 클론을 생성하기 위해, 중첩-확장 PCR을 사용하여 PCV1 감염성 클론의 백본에 있는 PCV1 캡시드 유전자를 PCV2b의 캡시드 유전자로 대체하였다(도 1b).

[도 1a] PCV2a-40895의 감염성 DNA 클론의 구축 방법 TAGIMG00 [도 1b] 키메라 PCV1-2b 감염성 DNA 클론의 생성 TAGIMG01


[0109] PCV2a 및 PCV2b 아형 사이의 항원 프로파일의 차이가 보고되었으며, 현재의 PCV2a계 상용 백신에 의한 충분한 수준의 교차 보호의 부족이 전 세계 돼지 개체군에서 PCV2b 아형과 관련된 PCVAD 중증도의 증가에 기여할 수 있다고 추측되었다...(중략)...본 발명의 결과는 새로운 PCV2b 아형의 캡시드에 기초한 생약독화 백신 PCV 1-2b가 PCV2a에 의한 이종성 챌린지로부터 보호하고, 따라서 PCV2a계 불활성화 상업용 백신에 의해 부여된 PCV2b 유형의 교차-보호의 이전 증거를 지지하게 되었다.
[0110] 요약하면, 본 발명의 데이터는 새로운 PCV2b 아형(new PCV2b subtype)에 기초한 키메라 PCV1-2b 백신 후보가 CD/CD 돼지에서 약독화되고 PCV2b 및 PCV2a 챌린지 각각 양쪽 모두에 대해 백신 접종된 종래 돼지에서 보호 및 교차-보호 면역을 유도함을 입증한다. 본 발명의 결과는 PCV2 감염 및 PCVAD에 대한 최초의 생약독화 백신으로서의 키메라 PCV1-2b 바이러스의 추가 발달에 대한 무대를 준비할 것이다. PCV1-2b 백신 바이러스만으로 PCV2a 및 PCV2b 아형 양쪽 모두에 대해 교차 보호를 제공하였다고 하더라도, 보다 완전한 보호를 위해 본 발명의 PCV1-2b 백신을 현재 PCV2a계 상용 백신과 조합하는 것이 장래에 더 유리할 수 있다.
[0114] 발명의 백신과 함께 투여될 수 있는 보조제는 백신에 대한 돼지의 면역학적 반응을 증가시키는 물질이다.
[0124] 본 발명의 새로운 백신은 임의의 특정 유형 또는 제조방법으로 제한되지 않는다.
백신은 변형 생백신, 불활성화 백신, 서브유닛 백신, 약독화 백신, 유전자 조작 백신 등을 포함하지만 이에 한정되지 않는다.
[마] 청구 범위
1. 1형 PCV(PCV1)의 게놈 서열로부터 유래된 비병원성 키메라 PCV를 인코딩하는 핵산분자, 및 2형 PCV(PCV2)의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 돼지 써코바이러스(PCV)의 핵산 분자.
16. 생리학적으로 허용 가능한 담체 및 하기 사항으로 이루어진 군으로부터 선택된 면역원성 양의 부재를 포함하는 바이러스 백신:
(a) 1형 PCV(PCV1)의 게놈 서열로부터 유래된 키메라, 비병원성 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 2형 PCV(PVC2)의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 돼지 써코바이러스(PCV)의 핵산 분자;
(b) PCV1의 게놈 서열로부터 유래된 키메라, 비병원성 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 PCV2의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 PCV의 핵산 분자를 함유하는 생물학적 기능성 플라스미드 또는 바이러스 벡터;
(c) PCV1의 게놈 서열로부터 유래된 키메라, 비병원성 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 PCV2의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 PCV의 핵산 분자를 함유하는 무독성, 감염성 비병원성 키메라 PCV; 및
(d) PCV2 캡시드 단백질의 적어도 일부를 포함하는 불활성화 키메라 PCV.

2) 선행발명 2(갑 제10호증, 을 제2호증) 선행발명 2는 2011. 12. 28. 공개된 중국공개특허공보 제102296089호에 게재된 ‘돼지 써코바이러스 2형 중공(empty) 캡시드 입자주5) 를 높은 효율로 제조하는 방법’에 관한 것으로, 그 주요 내용주6) 및 도면은 다음과 같다.


[가] 기술 분야
[0001] 본 발명은 진핵 생물 발현 시스템을 이용하여 써코바이러스 중공 캡시드 입자를 제조하는 방법에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 재조합 배큘로바이러스를 이용하여 곤충체내에서 항원 유전자 또는 인공 조작한 항원 유전자를 높은 효율로 발현하고 바이러스 중공 캡시드 입자를 조립하는 방법에 관한 것이며, 돼지 써코바이러스 질병을 예방하기 위한 유전자 공학 백신을 제조하는 데 사용되는 것으로 유전자 공학 및 수의학 생물 제품분야에 속한다.
[나] 배경기술
[0002] 1. 돼지 써코바이러스 질병 개요
[0003] PCV1은 병원성에 대한 명확한 증거가 없기 때문에 현재 연구의 주요 대상은 PCV2이다. 지금까지 NCBI 상에 등록된 완전한 게놈을 가진 PCV2의 바이러스주는 재조합 바이러스를 포함하여 이미 553개에 달한다.
[0005] 2. 돼지 써코바이러스 질병 백신 연구 및 제조
[0006] 현재 상업상 이용되며 일부 유럽 및 미국 국가에서 사용이 승인된 백신은 모두 보조제가 포함된 비활성화 PCV2 백신으로 주로 다음 몇 가지가 있다. 즉, (1) PCV1을 골격으로 하여 PCV2의 ORF2로 PCV1의 ORF2 부분을 치환하여 키메릭 바이러스를 구성하여 생백신을 제조한다. (2) PCV2 전체 바이러스 불활성화 백신이다. (3) PCV2의 ORF2를 발현하는 아단위 백신이다.
[0007] 이러한 유형의 백신에는 주로 다음과 같은 결함이 있다. 즉, 1. 불완전한 불활성화로 인해 면역 동물을 감염시키고 바이러스를 확산시킨다. 2. 세포 배양으로 수득한 바이러스 항원 함량이 적어 생산비용이 높아 우수한 면역 효과를 얻지 못한다. 이러한 이유로 돼지 써코바이러스에 대한 유전자 조작 백신의 연구에서는 대장균, 약독화된 가성광견병 바이러스의 생바이러스 벡터, 재조합 아데노바이러스 등을 모두 돼지 써코바이러스 2항원을 안전하게 생산하는 데 사용한다(수이후이 등, 돼지 써코바이러스 2형 백신 연구 진전 동물의학 진정, 2007년 12기). 그러나 이는 모두 돼지 써코바이러스 항원의 생산량을 크게 증가시키는 목적을 달성하지 못한다.
[0008] 3. 돼지 써코바이러스의 분자 생물학적 특성
[0009] 혈청학적 실험에 따르면, ORF1은 PCV1과 PCV2 사이에서 교차 반응성을 갖지만 ORF2는 특이적이며(Mahe et al., Differential recognition of ORF2 protein from type 1 and type 2 porcinecircoviruses and identification of immunorelevant epitopes. J Gen Virol, 2000. 81(Pt 7):p.1815-24), 두 가지 혈청형의 ORF2로 코딩된 단백질에는 항원 교차반응이 없으므로, 아단위 백신은 일반적으로 ORF2를 선택한다.
[다] 발명의 구성
[0026] 본 발명의 목적은 진핵 생물 발현 시스템을 제공하여 배큘로바이러스 발현 시스템을 이용하여 곤충 체내에서 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 조립함으로써 종래 기술의 단점을 극복하는 데에 있다.
[0027] 본 발명에서 해결하려는 기술적 문제는 하기 기술적 해결책을 통해 해결한다.
[0030] 곤충 생물 반응기를 사용하여 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 높은 효율로 제조하는 방법은 다음 단계를 포함한다. 즉, 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 형성에 필요한 상이한 바이러스주의 항원 유전자 cap과 인공 조작한 cap의 돌연변이체 유전자 cap1, cap2, cap3, cap4, cap5, cap6 등을 먼저 누에 배큘로바이러스 운반 벡터에 클로닝하여 상동 재조합 벡터 pVL-cap1, pVL-cap2, pVL-cap3, pVL-cap4, pVL-cap5, pVL-cap6을 획득하고 이러한 상동 재조합 벡터와 부모 바이러스 DNA를 곤충 세포 또는 박테리아에서 재조합 또는 전위를 수행하여 재조합 배큘로바이러스를 획득하며, 돼지 써코바이러스 2형 항원 유전자를 함유한 재조합 배큘로바이러스를 이용하여 곤충 또는 세포를 감염시키고; 감염된 곤충 숙주를 배양하고, 상응하는 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 높은 효율로 발현 및 조립하는 데에 필요한 유전자 구조 정보를 설계하여 얻고, 상기 관련 정보를 포함하는 cap7 유전자를 구축하여 누에 배큘로바이러스 운반 벡터에 클로닝하고 상동 재조합 벡터 pVL-cap7을 획득하며, 상동 재조합 벡터와 부모 바이러스 DNA를 곤충세포 또는 박테리아에서 재조합 또는 전위를 수행하여 재조합 배큘로바이러스를 획득하고, 이 재조합 배큘로바이러스를 사용하여 곤충 또는 세포를 감염시키고; 감염된 곤충 숙주를 배양하여 상응하는 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 높은 효율로 발현시키고; 상기 재조합 배큘로바이러스에 의해 발현된 산물을 수집 및 정제하여 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 수득할 수 있다.
[0031] 여기에서 상기 돼지 써코바이러스 2형의 상이한 바이러스주의 cap 유전자는 바람직하게는 SEQ ID No. 1, SEQ ID No. 2, SEQ ID No. 3, SEQ ID No. 4, SEQ ID No. 5, SEQ ID No. 6, SEQ ID No. 7, SEQ ID No. 8, SEQ ID No. 9, SEQ ID No. 10, SEQ ID No. 11, SEQ ID 12로 표시되는 DNA와 아미노산 서열 및 인공 개조를 거쳐 수득된 cap 유전자의 DNA 또는 아미노산 서열 SEQ ID No. 13과 SEQ ID No. 14로부터 선택되고, 여기에서 SEQ ID No. 13과 SEQ ID No. 14의 서열 특징은 하기 위치에서의 아미노산이 8Y, 12K, 17I, 30D, 47A, 59A이다.
[0039] 재조합 바이러스는 경구 또는 다양한 방법으로 표피를 통해 1일 내지 5일령(가장 바람직한 시간은 4일 또는 5일령 개미누에)의 곤충 에벌레 또는 번데기(가장 바람직한 시간은 1일 내지 2일의 초기 어린 번데기)를 감염시키며, 감염된 재조합 바이러스가 누에 내에서 복제되기 시작한 후 폴리헤드린 유전자(polh) 프로모터의 제어 하에서 cap 유전자가 대량으로 발현되기 시작하며, 고효율 핵 위치 신호의 안내 하에서 곤충 세포핵 내에 위치하고, 계속해서 cap 항원의 고효율 조립 부위 정보의 유도 하에서 대량의 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 바이러스 입자를 생산하며, 상기 재조합 바이러스가 곤충 체내의 지방체 내에서 우선적으로 발현된다는 것을 발견하였으므로, 대량 배큘로바이러스 복제와 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 바이러스 입자 발현과 조립 후, 지방체 조직과 세포가 파열 되고 대부분의 항원 단백질이 이어서 곤충의 체액으로 방출된다.
[라] 실시예
[0053] 본 발명의 방법은 배큘로바이러스 발현 시스템을 채택하여 누에 생물 반응기에서 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 바이러스 입자를 높은 효율로 발현 및 조립하며, 발현량은 동일 부피 곤충 세포 생산량의 10배 내지 100배이고 그램당 누에 또는 번데기는 밀리그램 수준의 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 바이러스 입자를 생산할 수 있으며, 이는 항원 생산 및 백신 제조의 비용을 크게 감소시킨다. 누에는 중국 위생부에서 식품 및 의약용 곤충으로 승인하였으므로, 본 발명의 방법으로 제조한 항원은 정제된 후 안전성이 매우 높아 백신 면역 동물을 직접 제조할 수 있다.

[도 3] 6개 cap 유전자 및 3개 핵 위치 신호 결실의 cap 유전자의 클로닝 모식도(NLS는 핵 위치 신호) TAGIMG02


[0204] 발현 산물은 초음파 파쇄와 초원심 분리를 통해 1차 정제한 후, 산물은 20만배 전자 현미경에서 모두 바이러스 입자가 관찰되었으며, 그 중 cap5와 cap2의 중공 캡시드 바이러스 입자가 상대적으로 비교적 많았다.
[0205] ELISA 결과에서 cap 유전자가 누에에서 높은 양으로 발현되며, 1024배 희석, 심지어 더 높은 희석도에서도 여전히 항원과 항체의 특이적 반응이 검출될 수 있는 것으로 나타났다. 이는 누에 혈림프에서 cap이 가용성으로 발현한다는 것을 나타내며, 발현량이 가장 많은 rBmNPV(cap5)이 100일 때 rBmNPV(cap1)는 29, rBmNPV(cap2)는 72, rBmNPV(cap3)는 43, rBmNPV(cap4)는 36, rBmNPV(cap6)는 27, rBmNPV(cap2DN)는 20, rBmNPV(cap4DN)는 18, rBmNPV(cap5DN)는 15이다.
[0210] 실시예 2
[0211] 누에 생물 반응기에서 개선된 돼지 써코바이러스 항원 유전자 cap7의 발현 및 중공 캡시드 입자의 조립
[0213] ...(중략)...cap7로 명명하여 뉴클레오티드 서열 SEQ ID No. 13과 SEQ ID No. 14를 획득하였다. cap7에는 고도로 발현된 8Y, 12K, 17I, 30D, 47A, 59A 등 특징 아미노산 서열이 포함되었다.
[0214] ...(중략)...ELISA를 통해 검출한 결과, 발현량은 가장 높은 rBmNPV-cap5의 5.3배임을 발견하였다. 이는 8Y, 12K, 17I, 30D, 47A, 59A 등 특징 아미노산 서열이 써코바이러스 중공 캡시드 입자의 고효율 발현과 조립에 필요하다는 것을 충분히 설명해 준다. 여기에서 8Y, 12K, 17I 및 30D는 발현 산물 cap을 곤충 세포 핵 내로 효율적으로 위치시키기 위해 필요하고, 47A 및 59A는 cap이 써코바이러스 중공 캡시드 입자를 높은 효율로 발현 및 조립하는 데 필요하다.
[마] 청구범위
1. 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 높은 효율로 제조하는 방법에 있어서, 써코바이러스 2형 중공 캡시드 형성에 필요한 상이한 바이러스주의 항원 유전자 cap, 인공 조작된 cap의 돌연변이체를 누에 배큘로바이러스 운반 벡터에 클로닝하여 상동 재조합 벡터를 획득하고, 상동 재조합 벡터와 부모 바이러스 DNA를 곤충 세포 또는 대장균에서 재조합 또는 전위(transposition)를 수행하여 재조합 배큘로바이러스를 획득하고, 항원 유전자를 포함하는 재조합 배큘로바이러스로 곤충을 감염시키며, 감염된 곤충 숙주를 배양하여 상응하는 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 발현시키고, 발현 산물을 수집 및 정제하여 상기 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 획득할 수 있는 것을 특징으로 하는 제조 방법.
2. 제 1항에 있어서,
돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드의 상이한 바이러스주의 cap 유전자는 SEQ ID No. 1, SEQ ID No. 2, SEQ ID No. 3, SEQ ID No. 4, SEQ ID No. 5, SEQ ID No. 6, SEQ ID No. 7, SEQ ID No. 8, SEQ ID No. 9, SEQ ID No. 10, SEQ ID No. 11 및 SEQ ID No. 12로 표시되는 DNA 및 아미노산 서열로부터 선택되는 것을 특징으로 하는 제조 방법.

다. 이 사건 심결의 경위(갑 제8호증) 1) 원고의 보정 전 이 사건 출원발명에 대하여, 특허청 심사관은 2017. 6. 14. 원고에게 ‘보정 전 이 사건 출원발명의 청구항 1 내지 20은 그 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 사람(이하 ‘통상의 기술자’라 한다)이 선행발명 1, 2의 결합으로부터 용이하게 발명할 수 있으므로 그 진보성이 부정되고, 청구항 9, 10, 12, 14, 15, 17은 특허법 제42조 제8항 및 시행령 제5조 제6항에 위반된다’라는 취지로 의견제출 통지를 하였다(갑 제2호증). 2) 원고는 2017. 8. 14. 이 사건 출원발명의 청구항 1, 6, 7, 9, 10, 12 내지 17, 19, 20을 보정하는 내용의 보정서 및 의견서를 제출하였으나(갑 제3호증), 특허청 심사관은 2017. 9. 8. ‘이 사건 출원발명의 보정된 청구항 1은 통상의 기술자가 선행발명 1, 2의 결합으로부터 쉽게 발명할 수 있으므로 그 진보성이 부정된다’라는 이유로 거절결정을 하였다(갑 제4호증). 3) 원고는 2017. 12. 7. 이 사건 출원발명의 청구항 1, 6, 7, 17, 18을 다시 보정하여 재심사를 청구하였으나(갑 제5호증), 특허청 심사관은 2018. 1. 5. ‘이 사건 제1 내지 11, 13 내지 19항 발명은 선행발명 1, 2의 결합으로부터 진보성이 부정되는 2017. 9. 8.자 거절이유를 해소하지 못하였다’라는 이유로 이 사건 출원발명에 대해 다시 거절결정을 하였다(갑 제6호증). 4) 원고는 2018. 4. 9. 특허심판원에 거절결정에 대한 불복심판을 청구하였고(2018원1542), 특허심판원은 2019. 12. 24. ‘이 사건 제1항 발명은 선행발명들과 기술분야 및 목적이 동일하고, 통상의 기술자가 선행발명 1, 2로부터 쉽게 도출할 수 있어 진보성이 부정되고, 청구범위가 둘 이상의 청구항으로 이루어진 경우에 어느 하나의 청구항에라도 거절이유가 있으면 그 출원은 일체로서 거절되어야 하므로 거절결정은 적법하다’라는 이유로 심판청구를 기각하는 이 사건 심결을 하였다(갑 제8호증). 【인정 근거】 다툼 없는 사실, 갑 제1에서 8호증, 변론 전체의 취지 2. 당사자 주장의 요지 가. 원고의 주장 원고는 이 사건 제1항 발명은 다음과 같은 이유로 선행발명 1에 선행발명 2를 결합하여 진보성이 부정되지 않으므로, 이와 달리 판단한 이 사건 심결은 위법하다고 주장한다. 1) 이 사건 제1항 발명의 구성요소 1에서 백신 조성물의 용도는 ‘PCV2b 분지형 균주’를 필수적으로 포함하면서 다른 PCV2 균주에 대해서도 추가적으로 보호하는 것인데, 선행발명 1, 2는 PCV2b 분지형 균주에 대한 보호와 관련된 내용을 포함하지 않으므로 이 사건 제1항 발명의 용도가 선행발명 1, 2로부터 쉽게 도출되지 않는다. 2) 선행발명 1의 PCV2b ORF2 폴리펩타이드를 선행발명 2의 cap4 폴리펩타이드 서열로 치환하여 백신 조성물에 사용될 수 있는 항원인 ‘PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드’를 쉽게 도출할 수 없다. 3) 선행발명 1, 2는 수중유 에멀젼 아쥬반트에 대하여 구체적으로 개시하고 있지 않고, 이러한 보조제 첨가에 따른 상승 작용을 암시할 만한 기재를 포함하지 않기 때문에, 수중유 에멀젼 아쥬반트를 포함하는 이 사건 제1항 발명을 쉽게 도출할 수 없다. 4) 이 사건 제1항 발명의 PCV2b 분지형 균주에 대한 백신 조성물은 PCV2b 분지형 균주뿐만 아니라 PCV2a, PCV2b 균주까지 면역원성을 제공하는 교차보호 효과를 나타내는데, 이러한 효과는 PCV2b 분지형 균주에 대하여 전혀 기재하고 있지 아니한 선행발명 1과 2로부터 예측될 수 없는 이질적이고 현저히 우수한 효과이다. 나. 피고의 주장 1) 이 사건 제1항 발명과 선행발명 1, 2는 모두 ‘PCV2’에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신을 제공하고자 하는 점에서 기술분야 및 목적이 공통되고, 이 사건 제1항 발명 백신 조성물의 용도는 선행발명 1, 2의 용도와 동일하다. 2) 선행발명 1에는 PCV2b 유전자형의 ORF2의 적어도 일부를 항원으로 사용한 백신 조성물이 PCV2a, PCV2b 모두에 교차보호 효과를 나타내는 것이 기재되어 있고, 선행발명 2에는 PCV2에 대한 백신 조성물의 제조에 사용될 수 있는 항원 중 하나로 이 사건 제1항 발명의 PCV2b 분지형 균주의 ORF2 폴리펩타이드와 동일한 서열을 갖는 cap4가 개시되어 있으므로, 선행발명 1의 PCV2b ORF2 폴리펩타이드 대신 선행발명 2의 cap4 서열을 단순히 치환하여 이 사건 제1항 발명의 구성요소 2를 쉽게 도출할 수 있고, 그 효과 또한 쉽게 예측할 수 있다. 3) 선행발명 1에 에멀젼 형태를 포함하는 다양한 아쥬반트가 기재되어 있고, 선행발명 2에도 항원을 아쥬반트로 에멀젼화하는 구성이 기재되어 있으므로, 선행발명 1, 2를 결합하여 수중유 에멀젼 아쥬반트를 쉽게 도출할 수 있다. 4) 따라서 이 사건 출원발명은 선행발명 1, 2의 결합에 의해 진보성이 부정되므로, 이와 결론이 같은 이 사건 심결은 정당하다. 3. 이 사건 심결의 위법 여부 가. 선행발명 1과 대비 1) 구성요소별 대응관계 이 사건 제1항 발명의 구성요소와 선행발명 1의 대응 구성요소는 아래 표와 같다.


구성요소	이 사건 제1항 발명	선행발명 1(갑 제9호증, 을 제1호증)
1	고병독성 돼지 써코바이러스 2b형(PCV2b) 분지형 균주를 포함하는 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물로서,	- PCV 감염 및 돼지 써코바이러스 관련 질병(PCVAD)으로부터 보호하는 방법에 관한 것이다(식별번호 [0002]).
		- 본 발명의 목적 중 하나는 새로운 PCV2b 아형에 기초한 차세대 백신을 개발하고, PCV2a 및 PCV2b 챌린지 양쪽 모두에 대한 PCV2b계 백신의 효능을 평가하는 것이다(식별번호 [0039]).
		- PCV1-2b로 명명된 약독화 키메라 바이러스는 PCV2b 챌린지로부터 돼지를 효과적으로 보호하며, PCV2b 및 PCV2a 아형 감염에 대한 보호 및 교차 보호를 제공하는 생백신 뿐만 아니라 불활성화(사멸) 백신으로 사용될 수 있다(요약서).
2, 4	상기 백신 조성물이, 서열번호 66과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 PCV2b 분지형 균주에 의해 암호화되는 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드, 상기 ORF2 폴리펩타이드가 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 59에 라이신(K), 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함하는, 백신 조성물.	- 본 발명은 1형 PCV(PCV1)의 게놈 서열로부터 유래된 비병원성 키메라 PCV를 인코딩하는 핵산 분자, 및 2형PCV(PCV2), 바람직하게는 아형 PCV2b의 캡시드 단백질의 인코딩 서열의 적어도 일부를 포함하는 돼지써코바이러스(PCV)의 핵산 분자를 제공한다(식별번호 [0007]).
2, 4		- 본 발명의 다른 실시형태에서, PCV2의 캡시드 단백질의 인코딩 서열은 PCV2, 바람직하게는 아형 PCV2b의 오픈 리딩 프레임 2(ORF2)의 적어도 일부이다(식별번호 [0010]).
3	및 수중유 에멀젼 아쥬반트를 포함하고,	- 본 발명의 백신과 함께 투여될 수 있는 보조제는 백신에 대한 돼지의 면역학적 반응을 증가시키는 물질이다...(중략)...적합한 보조제는 수산화 알루미늄(알룸), 면역 자극 복합체(ISCOMS), 비이온성 블록 중합체 또는 공중합체, 사이토카인(예를 들어 IL-1, IL-2, IL-7, IFN-α, IFN-β, IFN-γ), 사포닌, 모노포스포릴 지질 A(MLA), 뮤라밀 다이펩티드(MDP) 등을 포함하지만, 여기에 한정되지 않는다. 다른 적합한 보조제는 예를 들어 알루미늄 칼륨 설페이트, 대장균으로부터 단리된 열-불안정 또는 열-안정성 장독소, 콜레라 독소 또는 이의 B 서브유닛, 디프테리아 독소, 파상풍 독소, 백일해 독소, 프로인트(FREUND’s) 불완전 또는 완전 보조제 등을 포함한다(식별번호 [0114]).

2) 공통점과 차이점 가) 구성요소 1 (1) 구성요소 1 관련 ‘고병독성 PCV2b 분지형 균주를 포함하는 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물’에 관한 청구범위 해석 (가) 관련 법리 특허발명의 보호범위는 청구범위에 적혀 있는 사항에 따라 정해진다. 청구범위는 특허출원인이 특허발명으로 보호받고자 하는 사항을 적은 것이므로, 신규성·진보성을 판단하는 대상인 발명의 확정은 청구범위에 적혀 있는 사항에 따라야 한다. 다만 청구범위에 적혀 있는 사항은 발명의 설명이나 도면 등을 참작해야 그 기술적인 의미를 정확하게 이해할 수 있으므로, 청구범위에 적혀 있는 사항은 그 문언의 일반적인 의미를 기초로 하면서도 발명의 설명과 도면 등을 참작하여 그 문언으로 표현하고자 하는 기술적 의의를 고찰한 다음 객관적·합리적으로 해석하여야 한다. 그러나 발명의 설명과 도면 등을 참작한다고 하더라도 발명의 설명이나 도면 등 다른 기재에 따라 청구범위를 제한하거나 확장하여 해석하는 것은 허용되지 않는다(대법원 2012. 12. 27. 선고 2011후3230 판결, 대법원 2019. 10. 17. 선고 2019다222782, 222799 판결 등 참조). (나) 구체적인 판단 이러한 법리에 따라 이 사건을 본다. 갑 제1호증 등에서 알 수 있는 아래내용 등을 고려하면, 이 사건 제1항 발명에서 말하는 ‘고병독성 PCV2b 분지형 균주를 포함하는 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물[A vaccine composition for protecting pigs against PCV2, including a higly virulent porcine circovirus type 2b(PCV2b) divergent strain주7) ]’은 ① PCV2b 분지형 균주에 대해 돼지를 보호하고, ② PCV2 균주에 속하는 PCV2b 분지형 균주 이외의 다른 균주에 대해서도 돼지를 교차보호하는 기술적 의의를 갖는 백신 조성물이라고 해석하는 것이 타당하다.


[0006] 새로운 PCV2b 분지형의 증가된 병독성 보고와, 미국에서 의심되는 백신 실패 사례에서의 그 존재의 측면에서, 상기 새로운 PCV2b 분지형에 대해 유효한 백신이 필요하다.
[0132] 일 구현예에서, 상기 조성물은 또한 고전적 PCV2a 및 PCV2b 균주에 대한 이종성 보호를 제공한다.
[0332] 본 연구는 cPCV1-2b, PCV2b 분지형 및 PCV2a 캡시드 백신을 발현하는 배큘로바이러스가 PCV2b 분지형 균주 유발접종에 대해 교차 보호함을 나타내었다.
[0097] 본 원에서 사용된 바와 같이, 용어 “포함하는”은 조성물 및 방법에 인용된 요소가 포함하지만 다른 요소를 배제하지 않음을 의미하려는 것이다.

즉, 이 사건 제1항 발명의 ‘고병독성 PCV2b 분지형 균주를 포함하는 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물’은, 새로운 고병독성 PCV2b 분지형 균주에 의해 암호화되는 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드를 항원으로 사용하여 종래 PCV2 백신으로 예방에 실패했다고 보고된 PCV2b 분지형 균주뿐 아니라 PCV2a, PCV2b의 감염에 대해서도 교차보호 효과를 나타냄으로써, PCV2a, PCV2b와 같은 고전적인 PCV2 균주 및 새로운 고병독성 PCV2b 분지형 균주 모두에 대해 돼지를 보호한다는 것에 그 기술적 의의가 있다고 보아야 한다. (2) 구체적 검토 이 사건 제1항 발명의 구성요소 1은 ‘PCV2b 분지형 균주를 포함하는 PCV2’에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물에 관한 것이고, 선행발명 1의 대응 구성요소는 ‘PCV2b, PCV2a와 같은 PCV 감염’에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신에 관한 것으로, 양 발명의 대응구성은 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물인 점에서 서로 동일하다. 그러나 구성요소 1의 PCV2는 고병독성 PCV2b 분지형 균주를 포함하는데 비하여, 선행발명 1의 PCV는 PCV2a 및 PCV2b를 포함하지만 PCV2b 분지형 균주를 포함하는지에 대하여 기재되어 있지 아니한 점(이하 ‘차이점 1’이라 한다)에서 양 발명의 대응구성은 차이가 있다. 나) 구성요소 2, 4 이 사건 제1항 발명의 구성요소 2, 4는 ‘서열번호 66과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 PCV2b 분지형 균주에 의해 암호화되는 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드, 상기 ORF2 폴리펩타이드가 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 59에 라이신(K), 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함’하는 항원에 관한 것이고, 선행발명 1의 대응 구성요소는 ‘PCV2b의 ORF2의 적어도 일부’인 항원에 관한 것으로, 양 발명의 대응구성은 백신 조성물에 포함되는 ‘항원’이라는 점에서는 서로 동일하다. 그러나 이 사건 제1항 발명의 구성요소 2, 4의 항원은 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드로서 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 59에 라이신(K), 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함하는 특징을 갖는데 비하여, 선행발명 2의 항원은 PCV2b ORF2 서열의 적어도 일부로서 위치 59에 라이신(K), 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함하지 않는 점(이하 ‘차이점 2’라 한다)에서 양 발명의 대응구성은 차이가 있다. 다) 구성요소 3 이 사건 제1항 발명의 구성요소 3과 선행발명 1의 대응 구성요소를 비교하면, 백신 조성물에서 돼지의 면역학적 반응을 증가시키기 위해 첨가하는 아쥬반트라는 점에서는 동일하다. 그러나 이 사건 제1항 발명의 아쥬반트는 수중유 에멀젼 아쥬반트인데 비하여, 선행발명 1에는 다양한 아쥬반트가 기재되어 있지만 수중유 에멀젼 아쥬반트가 특정되어 기재되어 있지 않은 점(이하 ‘차이점 3’이라 한다)에서 양 발명의 대응구성은 차이가 있다. 나. 차이점에 대한 검토 1) 차이점 1 차이점 1은 ‘백신 조성물의 용도’에 관한 것인데, 이 사건 제1항 발명의 백신 조성물은 PCV2b 분지형 균주를 포함하는 PCV2에 대해 돼지를 보호하기 위한 것이나, 선행발명 1의 백신 조성물은 PCV2b, PCV2a와 같은 PCV2 감염에 대해 돼지를 보호하기 위한 것이라는 점이다. 앞서 든 증거에 변론 전체의 취지를 종합하여 인정할 수 있는 다음과 같은 사실과 사정에 따르면, 차이점 1은 통상의 기술자가 선행발명 1에 선행발명 2를 결합하여 쉽게 극복할 수 있다고 판단된다. (1) 이 사건 출원발명의 우선일 당시에는 PCV2 균주 유전자형에 관하여 아래와 같은 사실이 알려져 있었다. (가) PCV2 유전자형에는 PCV2a, PCV2b, PCV2c가 알려져 있었는데, 2000년대 초반까지는 PCV2a 유전자형이 주로 PCV2 감염을 일으켰으나, 2003년 이후에는 전 세계적으로 PCV2b 유전자형이 우세한 유병률을 나타내었다. (나) PCV2는 이 사건 출원발명의 우선일 당시 유전적 변화를 겪어왔는데, 구체적으로는 2002년 중국에서 PCV2a, PCV2b 유전자형에 비해 ORF2 아미노산 서열의 C-말단에 추가 라이신(K) 잔기를 갖는 PCV2 변종 균주가 최초로 분리되었고, 이후 2005, 2007, 2008, 2011, 2012년에는 다른 나라에서도 유사하게 ORF2 아미노산 서열의 C-말단에 라이신(K) 잔기가 추가된 돌연변이를 갖는 PCV2 변종 균주가 보고되었다(을 제7호증, “cap” CDS 서열 참조). 이러한 변종 균주로 감염된 돼지에서는 PCV2a, PCV2b에 감염된 경우에 비해 더 심각한 임상 징후와 병변이 발견되었고, 기존 백신을 투여한 경우에 백신 실패 사례가 보고되기도 하였다(갑 제1호증 식별번호 [0003] 내지 [0005], 갑 제14호증 참조). (다) 이러한 PCV2 변종 균주는 2010년에 새로운 유전자형인 ‘PCV2d’ 유전자형으로 명명되기도 하였으나(갑 제12호증, 을 제5, 6호증), 새로운 PCV2 유전자형 정의 및 명명법 기준에 따르면, 이들 모든 신규 변종 PCV2 균주는 공인된 PCV2 유전자형이 아니었으며 ORF2 유전자 뉴클레오타이드 서열의 계통발생적 분석에 기반하여 유전자형 PCV2b로 분류되었다(갑 제1호증, 식별번호 [0003] 내지 [0005] 참조). 따라서 PCV2 변종 균주는 ‘PCV2b mutant’, 즉 ‘PCV2b 돌연변이’, ‘PCV2b 변종’, ‘mPCV2b’ 등과 같이 다양하게 지칭되었다(갑 제14호증). (라) 이러한 이 사건 출원발명의 명세서 및 PCV2 관련 기술문헌의 기재를 통해, 통상의 기술자는 2002년 최초로 발견된 새로운 PCV2 변종 균주가 갖는 서열상 특징은 PCV2a, PCV2b 유전자형에 비해 ORF2 아미노산 서열의 C-말단에 추가된 라이신(K) 잔기이고, 임상적 특징은 증가된 병독성 또는 종래 백신 접종의 실패인 것으로 알려져 있었다고 인식된 것으로 보인다(이 사건 출원발명의 명세서 식별번호 [0006], [0098]로부터 이 사건 제1항 발명의 ‘PCV2b 분지형 균주’란 앞서 본 특징을 갖는 새로운 PCV2 변종 균주임을 알 수 있고, PCV2b 분지형 균주, PCV2b 분지형, PCV2b 변종, 신규한 변종 PCV2, 변종 PCV2로도 지칭되는데, 이하에서는 ‘PCV2b 분지형 균주’로 통일하여 지칭한다). (2) 선행발명 1에는 PCV2 백신과 관련하여 “PCV2a 백신이 교차보호를 제공하는 것으로 나타났기 때문에 PCV2a 아형계 백신은 전 세계적으로 여전히 사용되고 있다.”(식별번호 [0039]), “PCV2a 아형에 모두 기초한 4개의 상업용 백신이 개발되었으며 현재 돼지에서 전 세계적으로 사용되고 있다.”(식별번호 [0038]), “PCV2b 아형에 의한 상동성 챌린지 및 PCV2a 아형에 대한 이종성 챌린지로부터 동등하게 보호됨을 보여주었다. 따라서 새로운 생약독화 키메라 PCV1-2b 백신 후보는 PCV2 아형 양쪽 모두에 대한 보호 및 교차보호 면역 양쪽 모두를 유도하는 것으로 보인다.”(식별번호 [0107]), “본 발명의 결과는 새로운 PCV2b 아형의 캡시드에 기초한 생약독화 백신 PCV1-2b가 PCV2a에 의한 이종성 챌린지로부터 보호하고, 따라서 PCV2a계 불활성화 상업용 백신에 의해 부여된 PCV2b 유형의 교차보호의 이전 증거를 지지하게 되었다.”(식별번호 [0109])는 내용이 기재되어 있다. 이러한 선행발명 1의 기재 내용, 즉 PCV2a 백신이 교차보호를 제공하고, 새로운 PCV2b 아형에 기초한 백신이 이종성 챌린지로부터 보호한다는 내용과 선행발명 1이 PCV2a 백신의 교차보호의 이전 증거를 지지한다는 점주8) 등에 비추어 볼 때, 통상의 기술자는 PCV2a 유전자형의 ORF2를 항원으로 한 백신뿐만 아니라 PCV2b 유전자형의 ORF2를 항원으로 하는 백신 또한 다른 PCV2 유전자형에 대해 교차보호 효과를 나타낼 수 있다고 인식할 것이다. (3) 선행발명 2에는 백신 항원으로 사용될 수 있는 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 후보로 cap4가 제시되어 있고, 이의 아미노산 서열인 서열번호 8 또한 기재되어 있는데(을 제2호증, 청구항 2, 서열번호 8), 서열번호 8은 이 사건 제1항 발명의 항원인 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드 서열과 동일하고 C-말단에 라이신(K) 잔기를 갖는다. 또한 선행발명 2에는 cap4 서열에 대해서 “돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 형성에 필요한...(중략)...인공 조작한 cap의 돌연변이체 유전자 cap4 등을 먼저 누에 배큘로바이러스 운반 벡터에 클로닝하여...(중략)...재조합 배큘로바이러스를 획득하며, 돼지 써코바이러스 2형 항원 유전자를 함유한 재조합 배큘로바이러스를 이용하여 곤충 또는 세포를 감염시키고; 감염된 곤충 숙주를 배양하고, 상응하는 돼지 써코바이러스 2형 중공 캡시드 입자를 발현시킨다.”(갑 제10호증, 식별번호 [0030])고 기재되어 있다. 통상의 기술자는 위와 같은 선행발명 2의 기재 내용을 통해 cap4는 PCV2b 분지형 균주의 ORF2 폴리펩타이드 서열에 해당하고, PCV2에 대한 백신의 제조에 사용할 수 있는 항원이라고 인식할 것이다. (4) 따라서 통상의 기술자는 선행발명 2에 PCV2에 대한 백신의 제조에 사용할 수 있는 항원이라고 기재되어 있고 새로운 PCV2b 변종인 PCV2b 분지형 균주의 서열상 특징을 갖는 cap4를 PCV2b 분지형 균주에 대해 돼지를 보호하기 위한 백신 조성물의 항원으로 선택함으로써, 선행발명 1의 PCV2b ORF2 폴리펩타이드로 치환하는 구성을 도출하는 데 별다른 어려움이 없을 것으로 보이고, PCV2a, PCV2b에 대한 교차보호 효과 또한 쉽게 예측된다. (5) 이에 대하여 원고는, 선행발명 2의 실시예에서 실제로 백신 조성물로 제조하여 그 효과를 평가한 것은 cap7뿐인 점 등에 비추어 보면, cap4 폴리펩타이드 서열을 백신 조성물의 항원으로 사용하는 데 부정적 교시가 있다고 보아야 하므로, 통상의 기술자는 선행발명 2를 보고 백신 조성물의 항원으로 사용하기 위해 cap4 폴리펩타이드 서열을 선택하지 않을 것이라고 주장한다. 그러나 ① 선행발명 2의 실시예 3.5.3.4.에는 cap1 내지 cap6을 대장균에서 발현시키고 정제한 결과, 모두 바이러스 입자가 관찰되었다는 실험 결과가 기재되어 있고(을 제2호증, 식별번호 [0198] 내지 [0204]), ② 실시예 3.6에서 유전자의 발현 및 검출 시험을 수행한 결과, cap4 유전자를 포함한 모든 유전자의 발현 산물에서 모두 바이러스 입자가 관찰된 점(을 제2호증, 식별번호 [0204]), ③ 선행발명 2에서 돼지 써코바이러스 2형의 상이한 바이러스주의 바람직한 유전자의 하나로 cap4를 명확히 기재하고 있는 점(을 제2호증, 식별번호 [0031], [0033]) 등을 종합적으로 고려하면, 선행발명 2가 cap4에 대해 부정적으로 교시한다거나 항원으로 사용하는 것을 배제하려는 의도가 있다고 보기 어렵다. 이 부분 원고의 주장은 받아들이지 않는다. (6) 또한 원고는, 선행발명 1은 약독화된 키메라 바이러스를 포함하는 ‘생백신’에 관한 것이고, 선행발명 2는 cap7의 ‘빈 캡시드 입자를 포함하는 백신’에 관한 것이어서, 양 발명에 기재된 백신의 종류가 상이하므로 선행발명 1, 2를 결합하는 것이 용이하지 않다는 취지로 주장한다. 선행발명 1의 실시예에는 약독화된 키메라 PCV2b 바이러스 백신(선행발명 1에는 ‘PCV1-2b’라고 기재되어 있다)이 기재되어 있기는 하지만, 실시예에 기재된 키메라 백신은 다양한 백신 종류 중 하나의 예시로 든 것으로서 선행발명 1에는 “배큘로바이러스 벡터와 같은 표준 단백질 발현 벡터로 클로닝될 수 있고 적절한 숙주 세포를 감염시키는 데 사용될 수 있다”(을 제1호증, 식별번호 [0120]), “백신은 변형 생백신, 불활성화 백신, 서브유닛 백신, 약독화 백신, 유전자 조작 백신 등을 포함할 수 있다”(을 제1호증, 식별번호 [0124])는 등 다양한 백신 형태로 제조될 수 있다고 기재되어 있고,선행발명 2에도 “재조합 배큘로바이러스를 이용하여 곤충 체내에서 인공 조작한 항원 유전자를 발현하고 바이러스 중공 캡시드 입자를 조립하는 방법”(갑 제10호증, 식별번호 [0001])이 기재되어 있다. 이러한 기재 내용을 종합하면, 신규한 PCV2b 아형에 기초한 백신을 제공하기 위한 선행발명 1의 목적을 달성하기 위해, 선행발명 1에 백신의 한 형태로 기재되어 있는, 배큘로바이러스 벡터를 발현 벡터로 사용하여 제조한 백신에 관한 선행발명 2를 선행발명 1에 결합할 동기가 있다. 이와 전제가 다른 원고의 주장은 받아들일 수 없다. 2) 차이점 2 차이점 2는 백신 조성물의 ‘항원’에 관한 것인데, 이 사건 제1항 발명의 항원인 ‘서열번호 66과 95% 이상의 서열 동일성을 갖는 PCV2b 분지형 균주에 의해 암호화되는 PCV2b 분지형 ORF2 폴리펩타이드로, 폴리펩타이드가 서열번호 1의 넘버링에 따라 위치 59에 라이신(K), 위치 89에 류신(L), 위치 90에 트레오닌(T) 및 위치 134에 아스파라긴(N)을 포함’하는 구성은 다음과 같은 이유로 통상의 기술자가 선행발명 1에 선행발명 2를 결합하여 쉽게 도출할 수 있다. (1) 이 사건 출원발명은 고병독성 PCV2b 분지형 균주뿐만 아니라 고전적 균주인 PCV2a, PCV2b에 대한 보호 효과까지 제공하는 것을 기술적 과제로 하는 발명으로서, PCV2b 분지형 균주에 의해 암호화되는 ORF2 폴리펩타이드를 항원으로 사용하는 것을 과제 해결수단으로 하고 있다(갑 제1호증, 식별번호 [0006], [0007], [0012], [0132]). (2) 그런데 선행발명 2에 기재된 cap4가 PCV2b 분지형 균주의 ORF2 폴리펩타이드로서 PCV2에 대한 백신 제조에 항원으로 사용될 수 있음을 인식하고 있는 통상의 기술자는 PCV2b 균주에 의해 암호화되는 ORF2 폴리펩타이드를 백신 조성물의 항원으로 사용할 경우 PCV2b와 PCV2a 모두에 대한 교차보호 효과를 나타낼 수 있음을 제시하는 선행발명 1을 결합하여, 고병독성 PCV2b 분지형 균주뿐만 아니라 고전적 균주인 PCV2a, PCV2b에 대한 보호 효과를 나타내는 백신 조성물을 시도해 볼 동기가 충분하고 앞서 본 바와 같이 PCV2 계열 백신의 다른 유형에 대한 교차보호 효과가 알려진 상태에서 그 효과도 기대할 수 있었다고 판단된다. 3) 차이점 3 다음과 같은 이유로 이 사건 제1항 발명의 구성요소 3과 선행발명 1의 대응 구성요소 사이에 존재하는 차이점 3은 통상의 기술자가 선행발명 1로부터 쉽게 도출할 수 있다. (1) 다음과 같은 선행기술문헌들의 기재를 종합하면, 이 사건 출원발명의 우선권 주장일 무렵 백신 조성물에 면역보조제로 수중유 에멀젼 아쥬반트가 첨가될 수 있다는 것은 해당 기술분야의 상식이라고 판단된다.


▶ 을 제14호증(Vaccine Design: The Subunit and Adjuvant Approach, 1995. 6. 공개)
백신 보조제와 첨가제의 개요
구성성분/보조제(아쥬반트) 품명: MF59
구조: 스쿠알렌/수중유 에멀젼 (중략)
보조제(아쥬반트) 특성: 다양한 항원과 함께 조합하여 근육주사로 투여하여, 체액반응을 상승시키고, T세포의 생존과 림프사이트 세포의 존재를 증가시킨다(183면).
▶ 을 제15호증(Vaccine Adjuvants and Delivery Systems, 2007. 6. 공개)
외부적 인자에 대해 유효한 수준으로 면역반응을 상승시키도록 초기부터 그 시도가 있어 왔는데, 연구자들은 면역 반응을 증가시킬 수 있도록 항원과 함께 조합하여 쓸 수 있는 유용한 보조제를 구분하려고 시도해 왔다. 이러한 면역 반응을 증가시킬 수 있는 보조제는 아쥬반트라고 알려져 있다(1면의 ‘Introduction’, 제1 내지 4행 및 12면의 최하단으로부터 제6 내지 7행).
MF59: 안전하고 강력한 수중유의 에멀젼 아쥬반트(115면).
w/o 에멀젼(주9)의 반응성으로 인해, o/w(주10) 접근법을 대체물로서 평가하였고, 면역증강제의 전달 시스템으로서 초기에 촉진되었다(116면, 제25 내지 27행).

에멀젼주9) o/w주10) (2) 선행발명 1, 2에도 면역보조제로 아쥬반트가 사용될 수 있다고 기재되어 있고(을 제1호증 식별번호 [0114], 을 제2호증 식별번호 [0040], 청구항 11), 이 사건 출원발명의 명세서 식별번호 [0143]에도 백신에 포함될 수 있는 아쥬반트로 매우 다양한 아쥬반트가 기재되어 있으며, PCV2b 분지형 균주의 ORF2 폴리펩타이드를 백신 조성물의 항원으로 사용하는 경우 수중유 에멀젼 아쥬반트를 사용하는 구성에 특별한 기술적 의의가 있다고 볼 만한 사정도 없다. (3) 따라서 통상의 기술자는 통상적이고 반복적인 실험을 통해서 백신 조성물에 사용되는 면역보조제로서 구성요소 3에 제시되어 있는 수중유 에멀젼 아쥬반트를 쉽게 도출할 수 있다고 보아야 한다. 4) 효과의 대비 원고는 이 사건 제1항 발명의 백신 조성물이 종래 백신에 비하여 효과적으로 PCV2b 분지형 균주를 포함한 PCV2 감염을 예방하고, 특히 PCV2b 분지형 균주에 대하여 특이적이고 강력한 항체반응을 유도하는 등 선행발명 1, 2에 비하여 이질적이거나 예측할 수 없는 현저한 효과가 있다고 주장하므로(실시예　 4, 6, 7), 이에 대하여 살펴본다. (1) PCV2b 분지형 균주에 대한 효과 검토 이 사건 출원발명의 명세서 실시예 4([표 3] 내지 [표 8]주11) ), 실시예 7([표 16] 내지 [표 23], 도면 5 내지 7주12) 에는 돼지에 키메라성 PCV1:PCV2a(항원이 PCV2a ORF2인 백신에 해당한다), 키메라성 PCV1:PCV2b(항원이 PCV2b ORF2인 백신에 해당한다), 사멸된 PCV2b 분지형 백신(이 사건 제1항 발명에 대응되는 백신에 해당한다)으로 예방접종한 후 21일차에 PCV2b 분지형 균주로 유발접종한 경우의 백신 효과를 확인하기 위해 PCV2 바이러스혈증, 대변 박리, 면역조직화학 스코어, 림프모양 고갈 스코어 등을 확인한 실험 결과가 기재되어 있다. 그런데 PCV2 백신 업계에서 PCV2 백신을 제조할 때 PCV2의 ORF2 폴리펩타이드를 항원으로 하는 기술이 잘 알려져 있으므로(을 제1호증 식별번호 [0006], 을 제2호증 식별번호 [0009] 참조), PCV2b 분지형 균주의 ORF2 폴리펩타이드를 항원으로 사용하는 경우 PCV2b 분지형 균주에 대해 보호 효과를 나타낼 것이라는 것은 통상의 기술자가 자명하게 예상할 수 있다. 따라서 이 사건 제1항 발명이 PCV2b 분지형 균주에 대해 돼지를 보호하는 효과는 통상의 기술자가 예측할 수 없는 이질적인 효과로 보기 어렵다. 나아가 이 사건 출원발명에 기재된 실험 결과를 보더라도, 이 사건 출원발명의 명세서 ‘실시예 4의 결과 중 [표 5]에서 PCV2b 분지형 균주의 ORF2를 항원으로 사용한 백신 조성물(T12, □ 부분, 이 사건 제1항 발명에 대응되는 조성물)의 PCV2 대변 박리 수치(541)가 항원이 PCV2b ORF2인 백신 조성물(T10, □ 부분)의 PCV2 대변 박리 수치(65)에 비해 증가되어 있는 결과를 확인할 수 있고, [표 7]에도 T12의 면역조직 화학 스코어(2, □ 부분)가 T10의 면역조직화학 스코어(0, □ 부분)에 비해 증가되어 있는 결과를 확인할 수 있는 등 키메라성 PCV2b를 항원으로 사용한 백신 조성물에 비해 이 사건 제1항 발명의 백신 조성물이 PCV2b 분지형 균주에 대하여 양적으로 현저한 보호 효과를 나타낸다고 인정되지 않는다. TAGIMG03 (2) PCV2a, PCV2b 균주에 대한 교차보호 효과 검토 이 사건 출원발명의 명세서 실시예 4([표 3] 내지 [표 8]), 실시예 6([표 10] 내지 [표 15], 도면 2 내지 4주13) )에는 돼지에 키메라성 PCV1:PCV2a, 키메라성 PCV1:PCV2b, 사멸된 PCV2b 분지형 백신으로 예방접종한 후 21일차에 PCV2a 또는 PCV2b 균주로 유발 접종한 경우의 백신 효과를 확인하기 위해 PCV2 바이러스혈증, 대변 박리, 면역조직화학 스코어, 림프모양 고갈 스코어 등을 확인한 실험 결과가 기재되어 있다. 위에서 검토한 것과 같이 PCV2a와 PCV2b의 교차 보호 효과와 관련하여 신규한 PCV2b 아형에 기초한 백신이 PCV2b, PCV2a에 대해 돼지를 보호하는 효과가 있다는 사실이 선행발명 1에 기재되어 있으므로(을 제1호증, 식별번호 [0023] 참조), 이 사건 제1항 발명의 교차보호 효과는 통상의 기술자가 선행발명과 비교하여 예측할 수 없는 이질적인 효과가 아니다. 나아가 이 사건 출원발명에 기재된 실험 결과를 보더라도, PCV2b 유발접종에 대한 키메라성 PCVb 백신 및 PCV2b 분지형 백신 후보의 평가를 위한 ‘실시예 6’의 실험 결과 부분에 “모든 치료군은 35 및 44일에 유발접종 후 T01군으로부터 유의미하게 상이하였다”(식별번호 [0271]), “모든 백신군의 돼지는 위약과 비교된 경우 예방접종 후 28 내지 44일에 PCV2 항체 역가의 유의미한 증가를 나타내어, 예방접종 후 PCV2에 대한 활성 면역 반응을 시사하였다”(식별번호 [0281])고 기재되어 있으므로, 이 사건 제1항 발명의 백신과 대조군 백신 사이에 양적으로 현저한 효과가 있다고 인정되지 않는다. 또한 PCV2b-분지형 유발접종에 대한 두 백신 후보의 평가를 위한 ‘실시예 7’에서 “T03, T05 및 P06 군은 연구 28일에 최소 제곱 평균 DNA 카피가 유의미하게 더 낮은 박리를 갖는 것으로 주지되었다”(식별번호 [0309])고 기재되어 있어, PCV2b 분지형 균주의 ORF2가 항원인 백신 조성물(T04, □ 부분, 이 사건 제1항 발명에 대응되는 조성물)의 효과가 다른 대조군 백신 조성물에 비해 현저한 효과를 나타내는 것으로 인정될 수 없고, “유발접종 후 PCV2b 분지형 치료는 다른 치료만큼 강력하게 반응하지 않았다”(식별번호 [0318], 도 7, [표 21])는 기재로부터, 이 사건 제1항 발명의 백신 조성물이 키메라성 PCV1:PCV2a 또는 PCV1:PCV2b와 유사한 수준이거나 그 이하의 교차 보호 효과를 나타내는 것으로 인정된다. 따라서 이 사건 제1항 발명의 PCV2a, PCV2b에 대한 교차보호 효과는 선행발명들에서 도출되는 것 이상으로 양적으로 현저하거나 예측할 수 없는 효과를 나타낸다고 보기 어렵다. TAGIMG04 다. 소결론 이 사건 제1항 발명은 통상의 기술자가 선행발명 1, 2를 결합하여 쉽게 도출할 수 있고, 선행발명 1, 2와 비교하여 이질적이거나 현저한 효과가 있다고 보기 어려우므로 그 진보성이 부정된다. 라. 이 사건 심결의 위법 여부 이 사건 제1항 발명은 통상의 기술자가 선행발명 1, 2의 결합으로부터 쉽게 도출할 수 있어 진보성이 부정되고, 특허출원에서 청구범위가 둘 이상의 청구항으로 이루어진 경우 어느 하나의 청구항에 거절이유가 있는 때에는 그 특허출원 전부가 거절되어야 한다. 따라서 이와 결론이 같은 이 사건 심결은 적법하다. 4. 결론 이 사건 심결의 취소를 구하는 원고의 청구는 이유 없으므로 기각한다. 판사 우성엽(재판장) 이형근 김동규 주1) 2017. 12. 7. 재심사 단계에서 최종적으로 보정된 것이다. 청구항 1 이외의 나머지 청구항은 별지 1에 기재하였다. 주2) ‘오픈 리딩 프레임(Open Reading Frame)’의 약어로, 시작 코돈(AUG)과 종결 코돈(UAA, UAG 또는 UGA)을 양 말단에 포함하고 있어 mRNA로 전사되어 단백질이 될 가능성이 있는 염기서열 부위를 의미한다. 주3) 이 사건 심판에서는 ‘비교대상발명’으로 표시되어 있다. 선행발명의 순번은 이 사건 심판에서 비교대상발명으로 제시된 순서에 따라 선행발명 1, 2로 정한다. 주4) 선행발명 1의 주요 내용은 번역문의 해당 부분을 인용한다. 주5) 중공 캡시드 입자(empty capsid particle) : 바이러스 입자는 바이러스의 유전정보를 담은 게놈(DNA 또는 RNA)과 캡시드 단백질로 구성되는데, 게놈 없이 캡시드 단백질로만 구성된 바이러스 입자를 중공 캡시드 입자(빈 캡시드 입자)라고 한다(원고의 2020. 5. 18.자 준비서면 제4면 등 참조). 주6) 선행발명 2의 주요 내용은 번역문의 해당 부분을 인용한다. 주7) 갑 제17호증에 따르면, 이 부분에 대한 대응 해외 출원에서 이와 같이 사용되었다. 주8) 이 사건 출원발명의 우선권주장일 무렵 통상의 기술자에게 PCV2a 혹은 PCV2b 기반 백신이 유전형과 관계없이 교차면역을 제공한다는 점은 알려져 있었다고 판단된다. 주9) ‘유중수 에멀젼’을 의미한다. 주10) ‘수중유‘를 의미한다. 주11) 아래 별지 2에 기재되어 있다. 주12) 아래 별지 4에 기재되어 있다. 주13) 아래 별지 3에 기재되어 있다.

[출처] 대한민국 법원 : 종합법률정보 - 2020허2253 (3281609)

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